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牛源犬新孢子虫IMP1基因的克隆与序列分析

发表于:2022-10-22 19:15:04 来源:网友投稿

摘要 [目的]为了解牛源犬新孢子虫IMP1基因生物学特性,分析牛源犬新孢子虫IMP1基因的克隆与序列。[方法]应用PCR技术扩增IMP1基因,将纯化的PCR产物和pMD18-T Simple Vector连接,构建pMD18-IMP1重组克隆质粒,进行PCR鉴定和酶切鉴定,将鉴定为阳性的质粒进行测序分析。[结果]PCR扩增犬新孢子虫IMP1基因大小为762 bp,克隆质粒经测序分析与GenBank (XM_003879531.1)中IMP1基因的同源性为99.9%。[结论]该试验为犬新孢子虫IMP1基因的表达及后续研究奠定了基础。

关键词 犬新孢子虫;IMP1基因;克隆;序列分析

中图分类号 S188 文献标识码

A 文章编号 0517-6611(2014)15-04566-03

Abstract [Objective] In order to understand IMP1 genitival biological characteristics, analyze cloning and sequence of bovine Neospora caninum IMP1 gene. [Method] PCR technology was applied for amplification of IMP1 genes. The products of purified PCR were connected with pMD18-T Simple Vector to construct the pMD18-IMP1 cloned plasmid, then PCR identification and enzyme digestion identification of recombinant plasmid were conducted. The positive plasmid was identified by sequencing analysis. [Result] Neospora caninum IMP1 amplified by PCR is 762 bp, the analysis of sequencing results shows that the GenBank(XM_003879531.1) IMP1 is 99% in gene homology. [Conclusion] The method laid a foundation for expression and subsequent research of Neospora caninum IMP1 gene.

Key words Neospora caninum; IMP1 gene; Clone; Sequential analysis

新孢子虫病(Neosporiasis)是由犬新孢子虫引起的多种家畜的一种原虫病,该病可引起孕畜的流产、死胎,以及新生胎儿的运动障碍和神经系统疾病[1]。1988年Dubey等从瘫痪后肢的犬体分离了虫体,将其命名为犬新孢子虫[2]。犬新孢子虫为专性细胞内寄生原虫,隶属于复顶亚门原生动物门新孢子虫亚纲孢子虫纲新孢子虫属。新孢子虫病分布于世界各地,瑞士、挪威、芬兰、哥斯达黎加、爱尔兰、菲律宾、越南、泰国、以色列、俄罗斯、古巴等国都有因为新孢子虫病引发母牛流产的事件[3]。该病给畜牧业造成了巨大的经济损失,严重危害了养殖业的健康发展[4-5]。IMP1是2011年在巨型艾美耳球虫内发现的一类具有免疫保护性的蛋白,但该蛋白的来源和功能尚不明确。Cui等对犬新孢子虫IMP1基因蛋白进行了鉴定和定位的初步研究[6]。为了解牛源犬新孢子虫IMP1基因的生物学特性,笔者对IMP1基因进行克隆与序列分析,旨在为IMP1基因的表达及后续研究奠定基础。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 菌株与虫株。Ecoli.DH5α菌株、犬新孢子虫吉林株和感受态,均来自延边大学预防兽医学实验室。

1.1.2 主要试剂。DNA Marker2000、pMD18-T Simple Vector、XhoⅠ、EcoRⅠ和ExTaq DNA聚合酶,购自宝生物工程公司(大连);质粒提取试剂盒、蛋白酶K、溶菌酶和DNA凝胶回收试剂盒,购自OMEGA公司;其他试剂均为国产分析纯级,市售。

1.2 方法

1.2.1 引物的设计及合成。应用Primer Premier5.0及Oligo6.0软件设计了一对引物P1、P2,引物由上海英骏生物技术公司合成。(P1)上游:5′CGGGATCCATGGGAGGCGTTTGCTCTAA 3′;(P2)下游:5′CGGAATTCTTCAATGCCGGTCAGAAGC 3′。

1.2.2 IMP1基因的PCR扩增与鉴定。以犬新孢子虫吉林株基因组DNA为模板,PCR反应总体系为25 μl:2 μl dNTP,模板DNA 5 μl,上下游引物各1 μl,Taq酶0.25 μl,2.5 μl 10×PCR Buffer,ddH2O 13.25 μl。优化PCR反应条件为:95 ℃预变性5 min,94 ℃变性45 s,58 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,进行30个循环,最后72 ℃条件下延伸10 min。PCR反应结束后,将其产物进行琼脂糖凝胶电泳检测。

1.2.3 IMP1基因的克隆。用pMD18-T Simple Vector与纯化回收的IMP1片段进行连接,转入E.coli.DH5α感受态细胞,涂布于LB固体培养基上(含有Amp抗性)筛选阳性菌落。

1.2.4 重组质粒的PCR鉴定与酶切鉴定。提取重组质粒DNA,应用P1、P2进行PCR鉴定;应用EcoRⅠ和BamHⅠ进行双酶切鉴定。

1.2.5 IMP1基因片段的序列测定与分析。将鉴定正确的阳性克隆质粒送往上海英俊生物技术公司进行测序,并使用分子生物学软件 DNAstar系统对测序结果进行分析。

2 结果与分析

2.1 目的基因的扩增 以提取的犬新孢子虫吉林株基因组DNA为模板,P1、P2为引物,扩增出片段长度为762 bp的IMP1基因片段(图1)。

2.2 重组质粒pMD18-IMP1的鉴定 将IMP1基因与pMD18-T Simple Vector质粒连接,从而获得重组克隆质粒pMD18-IMP1,进行PCR扩增,得到与目的基因片段大小一致条带,说明重组质粒中含有IMP1基因。经EcoRⅠ和BamHⅠ双酶切鉴定,得到762 bp的目的片段和2 692 bp的载体片段(图2),说明IMP1基因成功克隆到pMD18-T Simple Vector上。

Bank (XM_003879531.1)中IMP1基因核苷酸的同源性为99.9%(图3)。而氨基酸66位编码的赖氨酸,突变之后编码甲硫氨酸,氨基酸同源性为99.6%(图4)。

3 讨论

禹海杰通过间接免疫荧光技术对弓形虫速殖子不同时期IMP1蛋白的表达特性研究发现,在游离、吸附于细胞表面、入侵中、入侵后及纳虫空泡中的速殖子IMP1均有表达,均被定位于虫体表面,且在有些虫体的顶端表达更为强烈[7]。Cui等对犬新孢子虫IMP1基因蛋白研究表明,IMP1基因蛋白编码1 182 bp的开放阅读框,编码393个氨基酸,编码的蛋白约42.9 kDa,该氨基酸序列没有信号肽和跨膜区,但有9个酰基化位点和14个磷酸化位点。试验选择IMP1开放阅读框内基因片段进行扩增与克隆,目的是为IMP1基因的表达和生物学特性的研究奠定基础。

试验对构建的IMP1基因重组质粒进行测序,得到的IMP1基因核苷酸长度为762 bp,编码243个氨基酸。核苷酸序列197位上测序为A,而NCBI中为T,与GenBank (XM_003879531.1)中IMP1基因核苷酸的同源性为99.9%;氨基酸66位编码的赖氨酸突变为甲硫氨酸,氨基酸同源性为99.6%,该突变是否对蛋白的表达及其他特性造成影响还有待于进一步研究。

参考文献

[1] BJERKAS I,MOHN S F,PRESTHUS J.Unidentified cyst-forming sporzoon causing encephalomyelitis and myositis in dogs[J].Zeitschr Parasitenkunde,1984,70(2):271-274.

[2] DUBEY J P,CARPENTER J L,SPEER C A,et al.A newly recognized fatal protozoan disease of dogs[J].J Am Vet Med Assoc,1988,192(9):1269-1285.

[3] OOI H K,H UANG C C,YANG C H,et al.Serological survey and first finding of Neospora caninum in Tai-wan,and the detection of its antibodies in various body fluids of cattle [J].Veterinary Parasitology,2000,90:47-55.

[4] 邓冲,张维,刘群,等.乳牛流产胎儿中新孢子虫的鉴定[J].中国兽医科学,2007,37(1):16-19.

[5] 张守发,丁德,鞠玉琳,等.胶体金免疫层析法与ELISA法对牛的新孢子虫血清抗体检测结果的比较[J].中国兽医杂志,2008,44(8):54-55.

[6] CUI X,LEI T,YANG D Y,et al.Identification and characterization of a novel Neospora caninum immune mapped protein 1 [J].Parasitology,2012,139(8):998-1004.

[7] 禹海杰.弓形虫疫苗候选抗原IMP1生物学特性及其免疫原性研究[D].杭州:浙江大学,2013.

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